虽然大主教不懂得军事，但在这个时候也明白，自巳取胜的希望并不大，而且败进了马尼拉城之后，大主教的头脑也淸酲了许多，知道光靠高喊信天主得永生是没有用的，虽说大主教的宗教情绪十分狂热，但并非全无理智和务实的头脑，尽管为宗教殉身在所不惜，但也应该珍惜自己的生命，而目考虑到在对方的阵营里也有传教士的存在，这也表示双方还是有一定的谈判基础，因此大主教也同意了总督的建议，和生理人谈判。
得到了弗朗西斯科的赞同之后，查孔也立刻开始行动，派遣总督府的参谋阿隆索为主使，以摩莱尔为副使，教会也派了一名懂中文的传教士让×托徳随他们一起前往，不仅是充当翻译，同时也争能够和对方的传教士联络勾通，促成这场谈判。
对于谈判，商毅一般都是不会拒绝，至少可以先听一听对方的意见，因此也让阿科尼纳出面，去迎接西班牙的使者。
见面之后，三名西班牙使者都对商毅单膝跪地，以欧州王室的最高礼仪，向商毅见礼。因为阿科尼亚在迎接他们的时候，己经告诉他们，商毅的身份是中国的皇帝。这一下到把这三个使者吓了一跳，原来人家的皇帝亲自出马了，那么这谈判还谈得成吗？三人心里都有些惴惴的，结果忘了向阿科尼亚探探口风。
见礼之后，商毅才用西班牙语道：“你们要来见我，有什么事情，尽管说吧。”
对方居然会说西班牙语，这个情况又把三人吓了一跳，互相看了看，阿隆索才首先发言，道：“尊敬的陛下，我们是为了和平而来的？”
商毅冷笑了一声，道：“和平？我还是第一次知道，在西班牙哈布斯堡王朝里，居然还有和平，从哥伦布发现了北美大陆之后，克尔特斯在墨西哥，皮萨罗在秘鲁，黎牙比实在吕宋的所做所为，我从来就没有听说去，西班牙会和谁讲过和平。”
阿隆索也怔了一怔，没想到商毅对西班牙的殖民发展历史会这么熟悉，但另一边的传教士让×托德却争辩道：“但是陛下，您所说的那些事情都已经是历史了，似乎轮不到我们来为此付责，但这一次明明您侵略了帝国的领土，破坏了菲律宾的和平局面，这总归是事实吧。”
商毅大笑道：“我第一次听说，原来吕宋是西班牙的领土，你们到达吕宋的时间还不到一百年，而早在两百年以前，吕宋就己经向大明称臣了。因此吕宋要算，也该是中国的领土，是你们西班牙侵略了中国的领土。”
阿隆索也怕说僵了，赶忙道：“尊敬的陛下，据我所知，菲律宾当时只能算是贵国的藩属，也并不能算贵国的领土吧？当然我们不是谈论历史的，只谈现在事情吧，我们确实是希望能够得到您的和平。”
商毅淡淡道：“我这一次出兵的原因，你们都应该十分清楚，就是因为你们屠杀马尼拉的华人所引起来的，我记得在战事开始之前，我曾给你们的总督写过一封信，提醒他注意自已的行为，如果有屠杀事情发生，我绝不会坐视不理的，可惜你们的总督似乎把我的警告当作一种空洞的恐吓。因此这次战争的责任完全在你们身上而不在于我。”
阿隆索也不禁有些尴尬，道：“对不起，这是我们的总督大人疏忽了，但我们愿意进行补救，重新挽回和平。”
商毅道：“好吼我到想听一听，你们打算怎样补救呢？居我所知，死于你们屠杀的华人己经超过了两千，也许还要更多，另有一万多人无家可归，你们怎么来补救这两千多条人命。”
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